MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB2

Total Repeats: 5087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009927	ACCA	2	8	34021	34028	50 %	0 %	0 %	50 %	158339922
502	NC_009927	TCG	2	6	34163	34168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339922
503	NC_009927	CCT	2	6	34190	34195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158339922
504	NC_009927	ATTTGA	2	12	34205	34216	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158339922
505	NC_009927	TAT	2	6	34264	34269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158339922
506	NC_009927	CAC	2	6	34344	34349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158339922
507	NC_009927	GCC	2	6	34396	34401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158339922
508	NC_009927	AAG	2	6	34489	34494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339924
509	NC_009927	AACC	2	8	34500	34507	50 %	0 %	0 %	50 %	158339924
510	NC_009927	TGA	2	6	34519	34524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339924
511	NC_009927	GAT	2	6	34597	34602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339924
512	NC_009927	CAT	2	6	34673	34678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339924
513	NC_009927	CAT	2	6	34732	34737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339924
514	NC_009927	A	6	6	34796	34801	100 %	0 %	0 %	0 %	158339924
515	NC_009927	AAGA	2	8	34850	34857	75 %	0 %	25 %	0 %	158339924
516	NC_009927	TCG	2	6	34866	34871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339924
517	NC_009927	GAT	2	6	34900	34905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339924
518	NC_009927	AGG	2	6	34953	34958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339924
519	NC_009927	TGC	2	6	34984	34989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339924
520	NC_009927	CAAA	2	8	35066	35073	75 %	0 %	0 %	25 %	158339924
521	NC_009927	GAAC	2	8	35189	35196	50 %	0 %	25 %	25 %	158339924
522	NC_009927	CAC	2	6	35209	35214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158339924
523	NC_009927	ACC	2	6	35256	35261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158339924
524	NC_009927	TTGGG	2	10	35423	35432	0 %	40 %	60 %	0 %	158339924
525	NC_009927	GTG	2	6	35470	35475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158339924
526	NC_009927	TGA	2	6	35484	35489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339924
527	NC_009927	GCA	2	6	35563	35568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339924
528	NC_009927	TGG	2	6	35573	35578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158339924
529	NC_009927	GAA	2	6	35596	35601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339924
530	NC_009927	AAT	2	6	35609	35614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158339924
531	NC_009927	TCT	2	6	35650	35655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158339924
532	NC_009927	TC	3	6	35776	35781	0 %	50 %	0 %	50 %	158339924
533	NC_009927	TTTC	2	8	35857	35864	0 %	75 %	0 %	25 %	158339923
534	NC_009927	AGC	2	6	35941	35946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339923
535	NC_009927	TGG	2	6	35959	35964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158339923
536	NC_009927	CGG	2	6	35992	35997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158339923
537	NC_009927	GCT	2	6	36038	36043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339923
538	NC_009927	CAA	2	6	36118	36123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339923
539	NC_009927	GGC	2	6	36141	36146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158339923
540	NC_009927	TGG	2	6	36178	36183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158339923
541	NC_009927	GAT	2	6	36251	36256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339923
542	NC_009927	TGA	2	6	36271	36276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339923
543	NC_009927	CATG	2	8	36302	36309	25 %	25 %	25 %	25 %	158339923
544	NC_009927	TTG	2	6	36373	36378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339923
545	NC_009927	CAT	2	6	36425	36430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339923
546	NC_009927	AGA	2	6	36437	36442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339923
547	NC_009927	GCA	2	6	36497	36502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339925
548	NC_009927	GCA	2	6	36596	36601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339926
549	NC_009927	GGC	2	6	36606	36611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158339926
550	NC_009927	TCA	2	6	36768	36773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339926
551	NC_009927	GGA	2	6	36864	36869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339926
552	NC_009927	ATTT	2	8	36902	36909	25 %	75 %	0 %	0 %	158339926
553	NC_009927	TTGG	2	8	36950	36957	0 %	50 %	50 %	0 %	158339926
554	NC_009927	AGG	2	6	37007	37012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339926
555	NC_009927	TGA	2	6	37015	37020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339926
556	NC_009927	TG	4	8	37180	37187	0 %	50 %	50 %	0 %	158339926
557	NC_009927	GTA	2	6	37435	37440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339927
558	NC_009927	CGC	3	9	37455	37463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158339927
559	NC_009927	ATTG	2	8	37515	37522	25 %	50 %	25 %	0 %	158339927
560	NC_009927	TG	3	6	37539	37544	0 %	50 %	50 %	0 %	158339927
561	NC_009927	ACT	2	6	37690	37695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339927
562	NC_009927	TGC	2	6	37701	37706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339927
563	NC_009927	T	6	6	37746	37751	0 %	100 %	0 %	0 %	158339927
564	NC_009927	GCT	2	6	37846	37851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339928
565	NC_009927	CAG	2	6	37869	37874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339928
566	NC_009927	T	6	6	37980	37985	0 %	100 %	0 %	0 %	158339928
567	NC_009927	TCA	2	6	38019	38024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339928
568	NC_009927	CGG	2	6	38186	38191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158339929
569	NC_009927	A	6	6	38218	38223	100 %	0 %	0 %	0 %	158339929
570	NC_009927	AAC	2	6	38322	38327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339929
571	NC_009927	TGT	2	6	38341	38346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339929
572	NC_009927	GCT	2	6	38355	38360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339929
573	NC_009927	CCA	2	6	38404	38409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158339929
574	NC_009927	CTG	2	6	38436	38441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339929
575	NC_009927	GTG	2	6	38445	38450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158339929
576	NC_009927	TGA	2	6	38512	38517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339929
577	NC_009927	TGT	2	6	38616	38621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339929
578	NC_009927	GAA	2	6	38840	38845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339929
579	NC_009927	AAC	2	6	38858	38863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339929
580	NC_009927	AGT	2	6	38885	38890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339929
581	NC_009927	AGA	2	6	39010	39015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339930
582	NC_009927	TGT	2	6	39052	39057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339930
583	NC_009927	TTC	2	6	39111	39116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158339930
584	NC_009927	GCA	2	6	39127	39132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339930
585	NC_009927	GCA	2	6	39164	39169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339930
586	NC_009927	TTGG	2	8	39195	39202	0 %	50 %	50 %	0 %	158339930
587	NC_009927	T	6	6	39387	39392	0 %	100 %	0 %	0 %	158339930
588	NC_009927	GA	3	6	39678	39683	50 %	0 %	50 %	0 %	158339931
589	NC_009927	CAG	2	6	39793	39798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339931
590	NC_009927	TGC	2	6	39926	39931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339931
591	NC_009927	AAC	2	6	39970	39975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339931
592	NC_009927	CAT	2	6	39989	39994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339931
593	NC_009927	TTG	2	6	39997	40002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339931
594	NC_009927	T	6	6	40069	40074	0 %	100 %	0 %	0 %	158339931
595	NC_009927	AGA	2	6	40094	40099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339931
596	NC_009927	TGA	2	6	40229	40234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339931
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598	NC_009927	GAT	2	6	40377	40382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339932
599	NC_009927	AGC	2	6	40462	40467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339932
600	NC_009927	TGGT	2	8	40520	40527	0 %	50 %	50 %	0 %	158339932
601	NC_009927	GCT	2	6	40553	40558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339932
602	NC_009927	ATC	2	6	40565	40570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339932
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604	NC_009927	CGTT	2	8	40590	40597	0 %	50 %	25 %	25 %	158339932
605	NC_009927	ATTC	2	8	40599	40606	25 %	50 %	0 %	25 %	158339932
606	NC_009927	TCG	2	6	40645	40650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339932
607	NC_009927	GCT	2	6	40682	40687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339932
608	NC_009927	CGC	2	6	40775	40780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158339932
609	NC_009927	TCT	2	6	40811	40816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158339932
610	NC_009927	GT	3	6	40826	40831	0 %	50 %	50 %	0 %	158339932
611	NC_009927	AC	3	6	40878	40883	50 %	0 %	0 %	50 %	158339932
612	NC_009927	TCA	2	6	40937	40942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339932
613	NC_009927	C	6	6	41018	41023	0 %	0 %	0 %	100 %	158339932
614	NC_009927	CAC	2	6	41064	41069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158339932
615	NC_009927	TGC	2	6	41138	41143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339932
616	NC_009927	TAGGGC	2	12	41185	41196	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158339932
617	NC_009927	CAC	3	9	41259	41267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158339932
618	NC_009927	CAG	3	9	41286	41294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339932
619	NC_009927	CAG	2	6	41352	41357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339932
620	NC_009927	TGCTAG	2	12	41395	41406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158339932
621	NC_009927	TGT	2	6	41441	41446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339932
622	NC_009927	AGC	2	6	41615	41620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339933
623	NC_009927	GAG	2	6	41701	41706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339933
624	NC_009927	CTG	2	6	41758	41763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339933
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